12月30日上午，中國科學院隆重舉行迎新年升國旗儀式。伴隨著雄壯的義勇軍進行曲，全國人大常委會副委員長，中國科學院院長、黨組書記路甬祥親手升起了鮮艷的五星紅旗。中國科學院常務副院長、黨組副書記白春禮，副院長、黨組成員李家洋、詹文龍，黨組副書記方新，中紀委駐院紀檢組組長、黨組成員王庭大，黨組成員、秘書長李志剛，副秘書長鄧麥村、曹效業和中科院機關全體職工參加了升旗儀式。升旗儀式由規劃戰略局局長潘教峰主持。
（規劃戰略局局長潘教峰主持升旗儀式）
路甬祥在升旗儀式上發表講話。他代表中國科學院，向全院廣大科技工作者、干部職工、青年學生和離退休老同志，向在中科院交流訪問的中外專家學者，向所有關心、支持中科院改革創新發展的各界人士致以新年祝福和親切問候，向節日期間仍堅守崗位的同志們表示敬意和感謝。
（全國人大常委會副委員長、中國科學院院長、黨組書記路甬祥講話）
路甬祥說，2009年是我國我院發展歷程上極不平凡的一年。新中國60年走過光輝征程，取得了舉世矚目的偉大成就，譜寫了自強不息的壯麗凱歌。在黨中央國務院的正確領導下，我國應對國際金融危機的一系列重大舉措取得明顯成效。中科院認真學習貫徹中央領導同志在建院60周年之際的指示和講話精神，深入貫徹落實科學發展觀，求真務實，改革創新，科技創新成效顯著，各項事業又好又快發展。
路甬祥說，2009年是中科院全面系統總結建院60周年歷程的一年。中科院建院60年來，始終與科學共進、與祖國同行，在落實科教興國戰略、建設國家創新體系和創新型國家的偉大實踐中闖出了一條自主創新的道路，發揮了科技國家隊的骨干引領與示范帶動作用。
路甬祥說，2009年是中科院科學前瞻、謀劃發展的一年。高質量完成了重要領域科技發展路線圖戰略研究工作，向國家提出了依靠科技創新構建我國八大經濟社會基礎和戰略體系的重要建議。發布了“創新2050：科技技術與中國的未來”戰略研究系列報告，得到國家有關部門、社會各界和國際科技界的高度關注和積極評價。制定了知識創新工程2020方案，正在全面推進“十二五”發展規劃制定工作。
路甬祥說，2009年也是中科院改革創新發展成果豐碩的一年。中科院組織實施“應對金融危機、支撐經濟發展科技創新專項行動計劃”，取得重要進展；積極建議和承擔國家、地方和企業重大科技任務，基礎前沿、戰略高技術和重大公益性研究取得了一批重大成果，例如，在世界上首次證明了iPS細胞的全能性；高溫超導體研究取得新的重要進展；建成了世界首個光量子電話網；我國第一套單精度峰值超過每秒1000萬億次浮點運算的超級計算系統研制成功并投入使用；成功建成世界上第一套萬噸級“煤制乙二醇”工業示范裝置；國家一類抗菌新藥鹽酸安妥沙星獲得新藥證書；完成了海陸一體化的《中華人民共和國1:100萬地貌圖集》的編制和出版；完成了至2050年大氣CO2濃度控制各國的排放配額估算，為我國參與國際氣候談判提供了重要科學依據和建議；高質量完成上海光源、LOMOST等多項大科學裝置建設。科技創新基地建設、研究所綜合配套改革、人才系統工程實施進展順利；科技布局調整取得新成效，5個新建所得到中編辦批準成立并通過驗收；院士增選工作順利完成；院地合作推動科技成果轉移轉化、對外開放與合作成效顯著；國家科學思想庫作用繼續有效發揮；全面加強黨的建設，為科技創新提供堅強有力的思想和組織保證。
路甬祥強調，在新的一年里，中國科學院將繼續高舉中國特色社會主義偉大旗幟，以鄧小平理論和“三個代表”重要思想為指導，以科學發展觀統領科技創新工作全局，奮勇拼搏，開拓創新，繼續深入實施知識創新工程，努力發揮中國科學技術“火車頭”的作用，在全面建設小康社會的偉大征程中做出新的更大貢獻！
